Report: Zdravotníci s třetí dávkou byli dokonale promořeni omikronem

Zdroj:  medRxiv - pdf ke stažení v angličtině

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

Titul:

Omikronová epidemie na soukromém shromáždění na Faerských ostrovech infikovala 21 z 33 třikrát očkovaných zdravotnických pracovníků 
Průběžný titul:

Omikronové ohnisko na Faerských ostrovech 
Autoři

Gunnhild Helmsdal; Služba praktického lékaře, Vestmanna, Faerské ostrovy

Olga Ę Hansen; Kancelář hlavního lékaře, Torshavn, Faerské ostrovy

Lars F IVl0ller; Kancelář hlavního lékaře, Torshavn, Faerské ostrovy

Debes Ç Christiansen; Faerská potravinová a veterinární správa, Torshavn, Faerské ostrovy

Maria Skaalum Petersen; Ústav pracovního lékařství a veřejného zdraví, Faerské ostrovy

Nemocniční služba, Torshavn, Faerské ostrovy; Centrum zdravotních věd, Univerzita Faerských ostrovů,

Torshavn, Faerské ostrovy

Marnar F Kristiansen; Centrum zdravotních věd, Univerzita Faerských ostrovů, Torshavn, Faerské ostrovy; Nemocniční služba na Faerských ostrovech, Torshavn, Faerské ostrovy Odpovídající autor:

Gunnhild Helmsdal, gunhetgls.fo, Gar9atun 12, 350 Vestmanna, Faerské ostrovy

Alternativní odpovídající autor:

Marnar Fri9heim Kristiansen, [email protected] , JC Svabos g0ta 14, Torshavn, Faerské ostrovy

Klíčová slova

Omicron; průlomová infekce; COVID-19; super roztírání; očkování

1

POZNÁMKA: Tento předtisk uvádí nový výzkum, který nebyl certifikován peer review a neměl by být používán jako vodítko pro klinickou praxi.

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

Abstraktní

Existují obavy, že varianta SARS-CoV-2 Omicron se vyhýbá imunitním reakcím kvůli neobvykle vysokému počtu mutací na spike proteinu. Zde informujeme o super-šířící se události omikronových infekcí mezi třikrát očkovanými zdravotnickými pracovníky, nakažených 21 z 33, kteří se zúčastnili soukromého setkání na Faerských ostrovech.

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

Jihoafričtí vědci byli první, kdo 24. listopadu ohlásil variantu Bl1.529 těžkého akutního respiračního syndromu Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) [1]. O dva dny později WHO pojmenovala variantu Omicron a klasifikovala ji jako variantu vzbuzující obavy (VOC) [2].

Varianta Omicron nese 26 až 32 mutací na spike proteinu, hlavním antigenním cíli protilátek generovaných infekcí nebo vakcinací [3,4]. První zprávy naznačují, že Omicron vykazuje vyšší přenositelnost a imunitní únikový potenciál než dřívější varianty, zatímco neutralizační studie prokázala nižší neutralizační aktivitu u dříve infikovaných a očkovaných proti variantě Omicron [5].

Ačkoli mnoho zemí po celém světě zavedlo cestovní omezení, aby omezilo přenos varianty Omicron, podařilo se této variantě během prvních týdnů prosince 2021 rychle rozšířit v Evropě i mimo ni. Rychlé rozšíření vedlo k očekávání, že se varianta Omicron stane dominující varianta v krátkém čase a sledování závažnosti a přenosnosti varianty Omicron je kritické v následujících týdnech a měsících [6].

Faerské ostrovy, samosprávná skupina ostrovů nacházející se mezi Islandem a Norskem, byly relativně úspěšné v potlačování pandemie COVID-19 [7,8]. Dne 30. prosince 2020 dostali první Faerští obyvatelé vakcínu BNT162b2 (Comirnaty; BioNTech, Mainz, Německo), jedinou vakcínu používanou na Faerských ostrovech, a od té doby byla očkována vysoká část populace. K 8. prosinci bylo 74,6 % populace očkováno dvakrát a 13,6 % třikrát [9]. Od března 2020 do září 2021 zaznamenaly Faerské ostrovy pouze 1 001 případů COVID-19 (1 867 na 100 000) a dvě úmrtí (3,73 na 100 000). Po uvolnění omezení a zavedení nakažlivější varianty Delta však ostrovy zasáhlo velké ohnisko s více než 3 300 případy a 11 úmrtími registrovanými během posledních dvou a půl měsíců [9].

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

Tento dokument uvádí superšířící se událost, kdy 21 z 33 zdravotnických pracovníků bylo infikováno variantou Omicron poté, co se zúčastnili společenského setkání na začátku prosince 2021, přestože všichni infikovaní účastníci byli třikrát očkováni a měli nedávný negativní test.

Metody

Kancelář hlavního lékaře provádí vyhledávání kontaktů na Faerských ostrovech tak, že vede rozhovory se všemi jednotlivci pozitivními na SARS-CoV-2 a identifikuje jejich blízké kontakty a stav jejich očkování [7]. Obvykle jsou do karantény požádáni pouze naivní kontakty SARS-CoV-2. Od doby, kdy se objevil Omicron, jsou však všechny kontakty s podezřelými jedinci pozitivními na Omicron požádány o sedmidenní karanténu. Jsou také požádáni, aby si okamžitě nechali udělat test PCR a ve dnech 4 a 6, bez ohledu na stav očkování. Všichni pozitivní jedinci se musí izolovat.

Faerské ostrovy provedly celosvětově nejvyšší počet testů na COVID-19 na obyvatele. Výtěry z krku jsou volně nabízeny v několika testovacích střediscích zřízených vládou, poté se v jedné ze dvou centralizovaných laboratoří provádí analýza PCR, přičemž výsledky testu jsou obvykle doručeny do 12–24 hodin. Všechny případy spojené se zahraničním cestováním, nebo kde je podezření na variantu Omicron, jsou genomově sekvenovány cíleným sekvenováním, kdy jsou sekvenovány části spike proteinu. Tato metoda je rychlejší než provádění sekvenování celého genomu viru, což umožňuje screening více případů.

Všichni pozitivní jedinci ze shromáždění souhlasili s účastí na této studii. Dvakrát byli dotazováni zaměstnanci v kanceláři hlavního lékaře. Poprvé to bylo krátce po pozitivním testu, kdy zaznamenali datum nástupu příznaků, stav očkování a osobní charakteristiky, a podruhé 12-14 dní po expozici, kdy byly registrovány příznaky, komorbidity a léky.

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

Výsledek

Začátkem prosince 2021 se soukromého setkání zúčastnilo 33 osob. Několik účastníků zaznamenalo symptomy během následujících dnů a provedlo test PCR, který byl pozitivní. Ostatní účastníci následně také provedli testy PCR, což vedlo k pozitivnímu testu 21 z 33 účastníků, což odpovídá míře napadení 63,6 %. Neobvykle vysoká četnost napadení vedla hlavního lékaře k žádosti o sekvenování genomu viru, přičemž byla 8. prosince identifikována první varianta Omicron na Faerských ostrovech. Dosud bylo získáno 13 vzorků ze shromáždění a další čtyři z rozšířeného přenosového řetězce. byla ověřena jako varianta Omicron prostřednictvím cíleného sekvenování. U zbývajících případů se také předpokládá, že jde o variantu Omicron. Nebylo možné definitivně identifikovat indexový případ, který inicioval tento přenosový řetězec, ale pravděpodobně byla varianta importována ze zahraničí.

Všichni infikovaní účastníci byli plně očkováni mRNA vakcínou BNT162b2 (Comirnaty; BioNTech, Mainz, Německo) a během posledních dvou a půl měsíců dostali třetí posilovací dávku a žádný z nich neměl v anamnéze předchozí infekci SARS-CoV-2. Charakteristiky účastníků jsou uvedeny v tabulce 1. Všichni infikovaní účastníci měli negativní test do 36 hodin před shromážděním. Většina z nich provedla test PCR, zatímco pět provedlo test laterálního průtoku. Všichni infikovaní jedinci pociťovali příznaky. Nejčastějšími příznaky byly bolesti svalů a kloubů, únava a horečka, naopak nejméně časté byly ztráta chuti a čichu. Nikdo nebyl přijat do nemocnice.

Pokud předpokládáme, že k expozici SARS-CoV-2 došlo večer v den shromáždění, inkubační doba byla krátká, v rozmezí 2 až 6 dnů, s průměrnou inkubační dobou 3,24 dne (95% CI 2 873,60). Doba do vymizení příznaků se lišila a na konci sledování pět jedinců stále hlásilo příznaky, zatímco zbytek hlásil příznaky trvající 1 až 9 dní.

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

Diskuse

Tato zpráva ukazuje, že varianta Omicron může vést k superrozšíření i u trojnásobně očkovaných lidí. Všechny hlášené případy byly symptomatické. Nikdo nebyl přijat do nemocnice. Existuje naléhavá potřeba výzkumu varianty Omicron, protože se očekává, že se současnou mírou růstu v krátké době ovládne šíření [10].

Primární šíření SARS-CoV-2 je přenosem z člověka na člověka, buď prostřednictvím respiračních kapének nebo aerosolů. Faktory, jako je vnitřní prostředí, špatná ventilace, hlasité mluvení, smích a zpěv, zvýší pravděpodobné šíření viru [11]. Tato studie ukazuje pokračující význam sociálního odstupu a vyhýbání se větším slavnostním shromážděním během pandemie při předcházení možným super-šířícím se událostem. Aktivní přenosový řetězec popsaný v této studii byl zdánlivě zastaven po přibližně 70 případech, což dokazuje, že prostřednictvím účinného sledování kontaktů lze přenosový řetězec Omicron udržet.

Stále jsou k dispozici omezené klinické údaje o variantě Omicron. Nicméně Brandal a kol. ohlásili podobné propuknutí jako v tomto dokumentu v Norsku, s vysokou mírou napadení 74 % a podobnými symptomy jako zde popsané případy [12]. Dále Espenhain a kol. zveřejnili první zprávu o prvních 785 případech Omicron v Dánsku. Zdůrazňují rychlé šíření této varianty a schopnost vyvolat superšíření a skutečnost, že vysoký podíl infikovaných byl plně očkován. Vzhledem k tomu, že mezi infekcí a hospitalizací a smrtí existuje určitá prodleva a tato varianta byla objevena teprve nedávno, nejsou zatím k dispozici dostatečné údaje pro vyvození závěrů o závažnosti [13].

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

Naše zjištění naznačují, že varianta Omicron vykazuje silné imunitní únikové vlastnosti a že dokonce i jedinci, kterým byla nedávno posílena (imunita), jsou vystaveni riziku infekce. Inkubační doba přípravku Omicron byla v této studii krátká. Pokud je inkubační doba pro Omicron kratší než u předchozích variant, může to potenciálně částečně vysvětlit zvýšenou infekci u jedinců s určitou imunitou. Z této malé studie není možné určit počet hospitalizací nebo úmrtnost. Dosud neznáme riziko rozvoje Long Covid po infekci Omikronem. I když případy v této studii primárně prodělaly relativně mírné onemocnění, všechny hlášené případy měly předchozí imunitu díky očkování. Je pozoruhodné, že všechny infikované případy zaznamenaly příznaky a že zejména ztráta chuti a čichu se zdá být v těchto případech méně častá ve srovnání s předchozími ohnisky. Je pravděpodobné, že očkování u varianty Omicron také chrání před závažným onemocněním, i když ochrana proti infekci do určité míry poklesla, což stále zdůrazňuje význam očkování. Je třeba poznamenat, že zjištění nemusí zobecňovat na naivní jedince SARS-CoV-2, a z tohoto důvodu je zapotřebí další výzkum společnosti Omicron mezi naivními osobami SARS-CoV-2.

Autorské příspěvky

GH a MFK napsal rukopis. OKH a LFM byly zodpovědné za vyhledávání kontaktů a rozhovory s účastníky. DHC byl zodpovědný za sekvenování virových genomů. GH, OKH, LFM, DC, MSP a MFK přispěly k interpretaci dat a přečetly, upravily a schválily konečný rukopis.

Poděkování

Rádi bychom poděkovali zaměstnancům ordinace hlavního lékaře a Faerského úřadu pro potraviny a veterinární péči za jejich neúnavnou práci v souvislosti s pandemií COVID-19.

Financování

Na tento dokument nebyly získány žádné finanční prostředky

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

Konflikt zájmů

Autoři neuvádějí žádný střet zájmů.

Etické prohlášení

Faerská etická komise rozhodla, že tento projekt patří do kategorie rejstříkového výzkumu, a nebyla povinna žádat výbor o schválení.

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

* Všichni infikovaní jedinci absolvovali tři očkování

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku. Je k dispozici pod mezinárodní licencí CC-BY-ND 4.0 .

Reference

1. Science Brief: Omicron (B.1.1.529) Varianta | CDC. Dostupné na: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-briefs/scientific-brief-omicron- variant.html. Zpřístupněno 13. prosince 2021.

2. Klasifikace Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern. Dostupné na: https://www.who.int/news/item/26-ll-2021-classification-of-omicron-(bll529)-sars-cov-2- variant-of-concern. Zpřístupněno 13. prosince 2021.

3. Varianty SARS-CoV-2 – Stanford Coronavirus Antiviral & Resistance Database (CoVDB). Dostupné na: https://covdb.stanford.edU/page/mutation-viewer/#omicron . Zpřístupněno 13. prosince 2021.

4. Sídlo Světové zdravotnické organizace. Posílení připravenosti pro Omicron (B.1.1.529): Stručná technická a prioritní opatření pro členské státy. Dostupné v:

https://www.who.int/publications/m/item/enhancing-readiness-for-omicron-(bll529)- technical-bri ef-and-priority-actions-for-member-

státy?fbclid=lwAR2N3613IVIxneZEWO00HXGSBRlZyoBPLRTc0JyGumdfVtGWzTYA3vzsdrcGY. Zpřístupněno 13. prosince 2021.

5. Cele S, Jackson L, Khan K, et al. SARS-CoV-2 Omicron má rozsáhlou, ale neúplnou neutralizaci vyvolanou Pfizer BNT162b2 a vyžaduje ACE2 k infekci. medRxiv 2021; :2021.12.08.21267417. Dostupné v:

http://medrxiv.org/content/early/2021/12/ll/2021.12.08.21267417.abstract .

6. Lesley S, Nei-yuan H, Sikhuline M, et al. Sledujte šíření Omicronu pomocí molekulárních dat. Věda (80 ) 2021; 0:eabn4543. Dostupné na: https://doi.org/10.1126/science.abn4543 .

7. Kristiansen M, Heimustovu B, Borg Sa , et al. Epidemiologie a klinický průběh případů onemocnění koronavirem první vlny, Faerské ostrovy. Emerg Infect Dis J 2021; 27. Dostupné na: https://wwwnc.cdc.gOv/eid/article/27/3/20-2589_article .

8. Str0m M, Kristiansen MF, Christiansen DH, Weihe P, Petersen MS. Eliminace COVID-19 na

medRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.21268021 ; tato verze zveřejněna 23. prosince 2021. Držitelem autorských práv k tomuto předtisku (který nebyl ověřen peer review) je autor/financovatel, který společnosti medRxiv udělil licenci k trvalému zobrazování předtisku.

Faerských ostrovech: účinnost masivního testování a intenzivního sledování případů a kontaktů. Lancet Reg Heal – Eur 2020; 0:100011. Dostupné v:

https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S2666776220300119 . Zpřístupněno 29. prosince 2020.

9. Statistika - Korona ß F0royum. Dostupné na: https://korona.fo/statistics . Zpřístupněno 13. prosince 2021.

10. Evropské centrum pro prevenci a kontrolu nemocí. Posouzení dalšího výskytu SARS-CoV-2 Omicron VOC v kontextu probíhajícího přenosu Delta VOC v EU/EHP, 18. aktualizace. Stockholm: 2021. Dostupné na:

https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-assessment-further-emergence-omicron-18th-risk-assessment . Zpřístupněno 17. prosince 2021.

11. Lotfi M, Hamblin MR, Rezaei N. COVID-19: Přenos, prevence a potenciální terapeutické příležitosti. Clin Chim Acta 2020; 508:254-266. Dostupné na: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32474009 .

12. Brandal LT, MacDonald E, Veneti L a kol. Ohnisko způsobené variantou SARS-CoV-2 Omicron v Norsku, listopad až prosinec 2021. Eurosurveillance 2021; 26. Dostupné na: https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.50.2101147 .

13. Espenhain L, Funk T, Overvad M, et al. Epidemiologická charakterizace prvních 785 případů varianty SARS-CoV-2 Omicron v Dánsku, prosinec 2021. Eurosurveillance 2021; 26. Dostupné na: https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.50.2101146 .

11